SURFSeq 5000 — первый полногеномный NGS-секвенатор в линейке приборов, выпускаемых китайской компанией GeneMind. Благодаря наличию двух проточных ячеек и увеличенной общей производительности в 1200 Гб, на этом приборе можно отсеквенировать до 8 полных геномов человека за запуск. Также прибор рекомендуется для секвенирования экзомов и транскриптомов (около 100 за запуск) и секвенирования единичных клеток. Секвенатор работает по технологии SURF-seqTM (секвенирование осуществляется с использованием четырех меченых разными флуорофорами нуклеотидов, 3′-конец которых заблокирован (обратимые терминаторы). Генерация кластеров ДНК, секвенирование синтезом и детекция флуоресценции происходят в одном приборе, без выполнения ручных операций.

В данной модели секвенатора реализована функция параллельного запуска ячеек, т.е. можно запустить секвенирование образцов на второй ячейке, во время работы прибора, не дожидаясь окончания секвенирования первой ячейки.

Для удобства управления системой имеется встроенный сенсорный экран. Секвенатор также имеет полный набор программного обеспечения (с возможностью обновления) для управления системой и первичной обработки данных и встроенный аппаратный модуль для ускорения вычислений.

Основные применения системы секвенирования SURFSeq 5000

• Секвенирование экзома (WES);
• секвенирование полных геномов (WGS) в том числе человека;
• таргетное секвенирование (большие панели генов 5-10 гб/образец);
• секвенирование транскриптома (RNAseq);
• метагеномное секвенирование (mNGS);
• анализ степени метилирования ДНК (WGBS).

Характеристики системы секвенирования SURFSeq 5000

• Количество рабочих ячеек секвенатора, шт. — 2;
• количество дорожек в ячейке для секвенирования, шт. — 4;
• возможность управления прибором с помощью сенсорного экрана — наличие;
• количество типов нуклеотидов, одновременно подаваемых в реакционный модуль в каждом цикле секвенирования, нуклеотида — 4;
• максимальное количество прочтений на одну ячейку средней производительности (FCM), млн — 500;
• максимальное количество прочтений на одну ячейку высокой производительности (FCH), млн — 2 000;
• максимальная производительность за один полный запуск прибора, ГБ — 1200;
• поддержка одноконцевых и парноконцевых прочтений — наличие;
• максимальная длина считываемого фрагмента ДНК при чтении с одного конца, нуклеотидов — 150;
• максимальная длина считываемого фрагмента ДНК при парноконцевом чтении, нуклеотидов — 300;
• максимальное время, необходимое для полного цикла работы прибора (включая генерацию кластеров, секвенирование ДНК и первичный анализ данных), ч — 47;
• поддержка библиотек TruSeq и Nextera — наличие;
• средняя точность прочтения по результатам всего запуска (Q30) — 85% оснований с точностью прочтения 99,9%;
• требования к сети — 220 В; 50/60 Гц;
• габаритные размеры (Ш×Г×В), мм — 1090×690×810;
• вес, кг — 240.

Комплектация системы секвенирования SURFSeq 5000

• Секвенатор;
• стартовый набор для инсталляции и обучения;
• источник бесперебойного питания;
• управляющий ПК;
• монтаж, пуско-наладка, инструктаж персонала на рабочем месте;
• гарантийное обслуживание 12 месяцев (возможна покупка дополнительной гарантии).

Настольный NGS-секвенатор средней производительности для различных применений. Рекомендуется для секвенирования небольших геномов и таргетного секвенирования ампликонов и панелей генов. Имеет возможность проведения генерации кластеров ДНК и секвенирования в одном приборе, без выполнения ручных операций. FASTASeq 300 является одним из самых быстрых секвенаторов, минимальное время секвенирования и обработки данных составляет 4,5 часа. Для удобства управления системой имеется встроенный сенсорный экран. Секвенатор также имеет полный набор программного обеспечения (с возможностью обновления) для управления системой и первичной обработки данных и встроенный аппаратный модуль для ускорения вычислений.

Основные применения системы для секвенирования FASTASeq 300

• Секвенирование экзома;
• секвенирование полных геномов;
• таргетное секвенирование (ампликоны, панели генов);
• секвенирование транскриптомов;
• метагеномное секвенирование;
• анализ степени метилирования ДНК;
• анализ ДНК-белковых взаимодействий;
• секвенирование свободно-циркулирующей ДНК;
• НИПТ, ПГТ-А.

Характеристики системы для секвенирования FASTASeq 300

• Количество рабочих ячеек секвенатора, шт. — 1;
• количество независимых дорожек в ячейке для секвенирования, шт. — 4;
• возможность управления прибором с помощью сенсорного экрана — наличие;
• количество типов нуклеотидов, одновременно подаваемых в реакционный
модуль в каждом цикле секвенирования — 4 нуклеотида;
• максимальное количество прочтений на одну ячейку, млн — 250;
• максимальная производительность за один полный запуск прибора, Гб — 75;
• поддержка одноконцевых и парноконцевых прочтений — наличие;
• максимальная длина считываемого фрагмента ДНК при чтении с одного конца, нуклеотидов — 150;
• максимальная длина считываемого фрагмента ДНК при парноконцевом чтении, нуклеотидов — 300;
• максимальное время, необходимое для полного цикла работы прибора (включая генерацию кластеров, секвенирование ДНК и первичный анализ данных), ч — 24;
• поддержка библиотек TruSeq и Nextera — наличие;
• средняя точность прочтения по результатам всего запуска (Q30) — 80% оснований с точностью прочтения 99,9%;
• требования к сети — 220 В; 50/60 Гц;
• габаритные размеры (Ш×Г×В), мм — 684×644×615;
• вес, кг — 145.

Комплектация системы для секвенирования FASTASeq 300

• Секвенатор;
• стартовый набор для инсталляции и обучения;
• источник бесперебойного питания;
• управляющий ПК (операционная система — Windows 10 Pro, CPU:Xeon SR 4216, Память: 192 GB DDR4; Hard Disk 1：446 GB SSD; Hard Disk 2：3,31 TB HDD);
• монтаж, пуско-наладка, инструктаж персонала на рабочем месте;
• гарантийное обслуживание 12 месяцев (возможна покупка дополнительной гарантии).

S100 — это настольный секвенатор, отличающийся компактным размером, интуитивно понятным управлением, высокой точностью секвенирования, гибкостью адаптации к различным сценариям и широким спектром выполняемых задач. Единственный прибор для массового параллельного секвенирования, в котором внедрен алгоритм коррекции ошибок (Error Correction Code), что позволяет повысить точность секвенирования в 10 раз.

Генерации кластеров ДНК и секвенирование осуществляются в одном приборе, без выполнения ручных операций. Два режима секвенирования: сверхбыстрый (BitSeq), подходящий для определения количественной структуры цепи (делеции, дупликации, небольшие CNV) и сверхточный (ECC), подходящий и для детекции низкочастотных вариантов.

Для удобства управления системой имеется встроенный сенсорный экран. Секвенатор также имеет полный набор программного обеспечения (с возможностью обновления) для управления системой и первичной обработки данных и встроенный аппаратный модуль для ускорения вычислений.

Основные применения секвенатора S100

• Таргетное секвенирование (ампликоны, панели генов);
• секвенирование транскриптомов;
• метагеномное секвенирование;
• детекция низкочастотных вариантов;
• анализ степени метилирования ДНК;
• анализ ДНК-белковых взаимодействий;
• секвенирование свободно-циркулирующей ДНК;
• НИПТ, ПГТ-А;
• секвенирование экзома;
• полноэкзомное секвенирование.

Характеристики секвенатора S100

• Количество рабочих ячеек секвенатора, шт. — 1;
• возможность управления прибором с помощью сенсорного экрана;
• максимальное количество прочтений на одну ячейку, млн — 100 и 200;
• максимальная производительность за один полный запуск прибора, Гб — 30;
• поддержка одноконцевых и парноконцевых прочтений;
• максимальная длина считываемого фрагмента ДНК при чтении с одного конца, нуклеотидов —150;
• максимальная длина считываемого фрагмента ДНК при парноконцевом чтении, нуклеотидов — 300;
• совместимость с библиотеками для секвенирования на платформах Illumina, Ion Torrent;
• средняя точность прочтения по результатам всего запуска (Q40) больше 80% оснований с точностью прочтения 99,99%;
• требования к сети — 220 В; 50 Гц;
• габаритные размеры (Ш×Г×В), мм — 550×650×650;
• вес инструмента, кг ≤ 80.

Комплектация:

• секвенатор;
• стартовый набор для инсталляции и обучения;
• источник бесперебойного питания;
• управляющий ПК (Операционная система — Windows 10 Pro, CPU：2,4 GHz*2. Память: 128 GB; Hard Disk 1 TB;
• монтаж, пуско-наладка, инструктаж персонала на рабочем месте;
• гарантийное обслуживание 12 месяцев (возможна покупка дополнительной гарантии).

• получить максимальную производительность секвенирования;
• контролировать длину секвенируемых фрагментов.

* Полные протоколы доступны на сайте www.nanoporetech.com для зарегистрированных пользователей-участников Nanopore Community.

Набор оптимизирован для высокопроизводительного секвенирования. Для максимальной производительности рекомендуется получать библиотеку из 100-200 фмоль высокомолекулярной ДНК. Также важна степень чистоты ДНК, загрязнения существенно снижают производительность. Рекомендуется использовать наноспектрофотометр для оценки степени чистоты ДНК по следующим критериям:

• A260/A280 = 1,8;
• А260/А230 = 2 - 2,2.

• магнитные частицы Agencourt AMPure XP (Beckman Coulter);
• набор для достройки концов ДНК NEBNext End repair / dA-tailing Module (New England Biolabs E7546);
• ДНК-лигаза NEBNext Quick Ligation Module (New England Biolabs E6056);
• 1,5 мл пробирки типа Эппендорф с низкой адгезивностью DNA LoBind (Eppendorf 0030108051);
• 0,2 мл тонкостенные пробирки для ПЦР (Axygen PCR-02-C);
• вода, не содержащая нуклеаз (Thermo Fisher Scientific R0581);
• свежеприготовленный 70% этанол.

• набор для репарации ДНК NEBNext FFPE Repair Mix (New England Biolabs M6630);
• пробирки для фрагментации ДНК Covaris g-TUBE.

• настольная микроцентрифуга (например, Eppendorf 5452000018);
• вортекс (например, Biosan BS-010203-AAG);
• магнитный штатив (Диаэм 3336);
• ротационный перемешиватель (например, Elmi RM1L);
• амплификатор (например, Thermo Fisher Scientific A37834);
• набор автоматических пипеток переменного объёма — от 0,5 до 10 мкл (например, Eppendorf 3120000020), от 2 до 20 мкл (например, Eppendorf 3120000038), от 10 до 100 мкл (например, Eppendorf 3120000046), от 20 до 200 мкл (например, Eppendorf 3120000054) и от 100 до 1000 мкл (например, Eppendorf 3120000062);
• наконечники с фильтром к автоматическим пипеткам;
• термоконтейнер со льдом;
• таймер (например, TR118OS).

• флуориметр Qubit 4.0 (Thermo Q33227);
• система для фрагментного анализа (например, Qsep 100);
• наноспектрофотометр (например, NanoDrop 2000C);
• система для препаративного электрофореза BluePippin.

Набор чипов содержит 4 штрихкодированных чипа для секвенирования с помощью систем Ion S5 и Ion S5 XL. Чип Ion 540 Chip обнаруживает встраивание оснований под действием полимеразы без использования флуоресценции, благодаря чему позволяет проводить секвенирование 60-80 млн фрагментов длиной 200 п.н. в в течение всего 2,5 часов. Поддерживает различные исследовательские приложения, включая секвенирование до трех экзомов человека, профилирование транскриптома и целевое повторное секвенирование генных панелей.

• изучать модифицированные нуклеотиды и другие характеристики нативной РНК;
• секвенировать молекулы РНК, которые плохо подвергаются обратной транскрипции.

Особенности набора

* Полные протоколы доступны на сайте www.nanoporetech.com для зарегистрированных пользователей-участников Nanopore Community.

Набор предназначен для работы с молекулами РНК, обладающими 3’-концевыми полиА –структурами — эукариотическими мРНК, полиаденилированными вирусными РНК или РНК, обработанными наборами для полиаденилирования. Для РНК без полиА-концов можно синтезировать пользовательские адаптеры, комплементарные 3’-концам (например, для тРНК или 16S-РНК).

В отличие от протоколов секвенирования кДНК, в случае использования набора Direct RNA Sequencing Kit происходит секвенирование нативных молекул РНК; только они проходят через поры проточной ячейки.

Стадия обратной транскрипции при пробоподготовке опциональна, но настоятельно рекомендуется — это повышает производительность секвенирования.

Набор Direct RNA Sequencing Kit незаменим в случае анализа модифицированных нуклеотидов. Если задача выявления таких нуклеотидов не ставится, рекомендуются наборы для секвенирования кДНК, так как они обеспечивают более высокую производительность.

• настольная микроцентрифуга (например, Eppendorf 5452000018);
• вортекс (например, Biosan BS-010203-AAG);
• магнитный штатив (Диаэм 3336);
• ротационный перемешиватель (например, Elmi RM1L);
• амплификатор (например, Thermo Fisher Scientific A37834);
• набор автоматических пипеток переменного объёма — от 0,5 до 10 мкл (например, Eppendorf 3120000020), от 2 до 20 мкл (например, Eppendorf 3120000038), от 10 до 100 мкл (например, Eppendorf 3120000046), от 20 до 200 мкл (например, Eppendorf 3120000054) и от 100 до 1000 мкл (например, Eppendorf 3120000062);
• наконечники с фильтром к автоматическим пипеткам;
• термоконтейнер со льдом;
• таймер (например, TR118OS);
• флуориметр Qubit 4.0 (Thermo Q33227).

Опционально:

• система для фрагментного анализа (например, Qsep 100);
• наноспектрофотометр (например, NanoDrop 2000C).

• построение точного экспрессионного профиля;
• секвенирование транскриптома;
• выявление и количественная оценка антисмысловых транскриптов и перекрывающихся генов.

• набор реагентов для получения библиотеки;
• комплект для обогащения мРНК Poly(A) RNA Selection Kit;
• набор индексов для бар-кодирования Lexogen i7 6 nt Index Set (7001-7008, 7001-7024 или 7001-7096, в зависимости от размеров набора);
• набор с магнитными частицами для очистки РНК;
• дополнительные реагенты не требуются.

• построение точного экспрессионного профиля;
• секвенирование транскриптома;
• выявление и количественная оценка антисмысловых транскриптов и перекрывающихся генов.

• набор реагентов для получения библиотеки;
• набор индексов для бар-кодирования Lexogen i7 6 nt Index Set (7001-7008, 7001-7024 или 7001-7096, в зависимости от размеров набора);
• набор с магнитными частицами для очистки РНК.

• возможно объединение до 12 образцов в общую библиотеку с целью снижения стоимости запуска секвенатора;
• исходное количество ДНК невелико;
• предполагается оптимизировать эксперимент с целью макисмального выхода;
• требуется контроль длины рида;
• секвенируется кДНК или специфические ампликоны.

* Полные протоколы доступны на сайте www.nanoporetech.com для зарегистрированных пользователей-участников Nanopore Community.

Набор PCR Barcoding Kit также может быть использован в сочетании с набором PCR cDNA Sequencing Kit (SQK-PCS109) для мультиплексного секвенирования кДНК.

Пробоподготовка заключается в опциональной фрагментации геномной ДНК с последующей достройкой концов, лигировании адаптеров к достроенным концам и ПЦР с праймерами, содержащими бар-коды. В состав набора входит 12 пар бар-кодированных праймеров. В конечном итоге образцы после ПЦР объединяются, и к смеси добавляются сиквенсные адаптеры.

Длины фрагментов, получаемых в ходе ПЦР, зависят от длины исходной матрицы и от процессивности ДНК-полимеразы. Максимальная длина рида составляет в среднем около 2 тыс п.н.

Пользователь также может использовать метод ПЦР с 2 парами праймеров (nested PCR); при этом одна пара праймеров - пользовательские праймеры к определённой последовательности ДНК, а вторая - бар-кодированные праймеры из набора. 5’-концы пользовательских праймеров должны быть комплементарны 3’-концам бар-кодированных праймеров.

Последовательности бар-кодов автоматически распознаются программой для интерпретации данных секвенирования, и риды группируются в соответствии с бар-кодами.

Ещё одно преимущество набора — если исходная ДНК загрязнена, то в ходе ПЦР существенно снижается концентрация примесей, которые могут ингибировать процесс получения библиотеки.

Если количество исходной ДНК менее 1 нг — рекомендуется предварительная полногеномная амплификация.

• магнитные частицы Agencourt AMPure XP (Beckman Coulter);
• набор для достройки концов ДНК NEBNext End repair / dA-tailing Module (New England Biolabs E7546);
• набор для лигирования ДНК NEB Blunt/TA Ligase Master Mix (New England Biolabs M0367);
• мастер-микс для ПЦР длинных фрагментов, например, LongAmp Taq 2X Master Mix (New England Biolabs M0287);
• 1,5 мл пробирки типа Эппендорф с низкой адгезивностью DNA LoBind (Eppendorf 30108051);
• 0,2 мл тонкостенные пробирки для ПЦР (Axygen PCR-02-C);
• вода, не содержащая нуклеаз (Thermo Fisher Scientific R0581);
• свежеприготовленный 70% этанол;
• буфер 10 мМ Трис-HCl с 50 мМ NaCl.

• пробирки для фрагментации ДНК Covaris g-TUBE.

• настольная микроцентрифуга (например, Eppendorf #5452000018);
• вортекс (например, Biosan BS-010203-AAG);
• магнитный штатив (Диаэм 3336);
• ротационный перемешиватель (например, Elmi RM1L);
• амплификатор (например, Thermo FS A37834);
• набор автоматических пипеток переменного объёма — от 0,5 до 10 мкл (например, Eppendorf 3120000020), от 2 до 20 мкл (например, Eppendorf 3120000038), от 10 до 100 мкл (например, Eppendorf 3120000046), от 20 до 200 мкл (например, Eppendorf 3120000054) и от 100 до 1000 мкл (например, Eppendorf 3120000062);
• наконечники с фильтром к автоматическим пипеткам;
• термоконтейнер со льдом;
• таймер (например, TR118OS).

• флуориметр Qubit 4.0 (Thermo Q33227);
• система для фрагментного анализа (например, Qsep 100);
• наноспектрофотометр (например, NanoDrop 2000C).

• построение точного экспрессионного профиля;
• секвенирование транскриптома;
• выявление и количественная оценка антисмысловых транскриптов и перекрывающихся генов.

• набор реагентов для получения библиотеки;
• комплект для обогащения мРНК Poly(A) RNA Selection Kit;
• набор буферов и колонок для очистки РНК;
• дополнительные реагенты не требуются.

Набор содержит материалы, необходимые для проведения двух инициализаций и автоматического секвенирования двух многополосных чипов за запуск с помощью интегрированного секвенатора Ion Torrent Genexus. Набор автоматизирует секвенирование библиотек Ion AmpliSeq или Ion AmpliSeq HD с длиной чтений 200-400 п.н.

Содержимое и условия хранения

• Genexus Cartridge, от -10 до -30°C;
• Genexus Bottle 2, при комнатной температуре;
• Genexus Bottles 1 and 3, при комнатной температуре.

• работать с небольшим исходным количеством ДНК;
• контролировать длину секвенируемых фрагментов;
• оптимизировать эксперимент для максимальной производительности;
• проводить таргетное секвенирование.

Особенности набора:

* Полные протоколы доступны на сайте www.nanoporetech.com для зарегистрированных пользователей-участников Nanopore Community.

Пробоподготовка заключается в опциональной фрагментации ДНК с последующей достройкой концов до тупых и присоединением 3’-dA. К 3’-dA лигируются олигонуклеотиды, содержащие сайты связывания ПЦР-праймеров. ДНК амплифицируется, и к ампликонам присоединяются сиквенсные адаптеры.

Стадия ПЦР зависит от исходного количества ДНК и желаемой длины ампликонов. Рекомендуемый протокол ПЦР рассчитан на 100 нг исходной ДНК.

Длина рида составляет в среднем около 2 килобаз и зависит не столько от процессивности Taq-полимеразы, сколько от особенностей пробоподготовки. Но при этом максимальная длина рида выше, чем при использовании набора Rapid PCR Barcoding Kit и может достигать 10 килобаз.

Пользователь также может использовать метод ПЦР с 2 парами праймеров (nested PCR); при этом одна пара праймеров — пользовательские праймеры к определённой последовательности ДНК, а вторая — бар-кодированные праймеры из набора. 5’-концы пользовательских праймеров должны быть комплементарны 3’-концам бар-кодированных праймеров.

Набор позволяет работать с ДНК, содержащей примеси, которые снижают эффективность получения библиотеки. Это происходит благодаря стадии ПЦР. Но необходимо учитывать, что амплификация разных фрагментов может идти с разной эффективностью.

Если исходное количество ДНК менее 1 пг, рекомендуется полногеномная амплификация.

В состав PCR Sequencing Kit также входит набор Flow Cell Priming Kit для загрузки библиотеки в поточную ячейку.

Условия хранения: -20 °С.

Дополнительные расходные материалы и реактивы:

• магнитные частицы Agencourt AMPure XP (Beckman Coulter);
• набор для достройки концов ДНК NEBNext End repair / dA-tailing Module (New England Biolabs E7546);
• ДНК-лигаза NEB Blunt/TA Ligase Master Mix (New England Biolabs M0367);
• 1,5 мл пробирки типа Эппендорф с низкой адгезивностью DNA LoBind (Eppendorf 30108051);
• 0,2 мл тонкостенные пробирки для ПЦР (Thermo FS AB0620);
• вода, не содержащая нуклеаз (Thermo FS R0581);
• мастер-микс для ПЦР LongAmp Taq 2X (New England Biolabs M0287);
• свежеприготовленный 70% этанол;
• буферный раствор Tрис-HCl 10 мМ рН 8.0 с 50 мМ NaCl.

Опционально:

• экзонуклеаза I (New England Biolabs M0293);
• пробирки для фрагментации ДНК Covaris g-TUBE.

Дополнительное оборудование:

• настольная микроцентрифуга (например, Eppendorf 5452000018);
• вортекс (например, Biosan BS-010203-AAG);
• магнитный штатив (Диаэм 3336);
• ротационный перемешиватель (например, Elmi RM1L);
• амплификатор;
• набор автоматических пипеток переменного объёма — от 0,5 до 10 мкл (например, Eppendorf 3120000020), от 2 до 20 мкл (например, Eppendorf 3120000038), от 10 до 100 мкл (например, Eppendorf 3120000046), от 20 до 200 мкл (например, Eppendorf 3120000054) и от 100 до 1000 мкл (например, Eppendorf 3120000062);
• наконечники с фильтром к автоматическим пипеткам;
• таймер (например, TR118OS).

Опционально:

• флуориметр Qubit (Thermo FS Q33227) или аналогичный;
• система для фрагментного анализа (например, Qsep 100);
• наноспектрофотометр (например, NanoDrop 2000C).

• идентифицировать видовую принадлежность бактерий;
• объединять несколько образцов в одну библиотеку

Объединение нескольких образцов, или мультиплексирование, возможно благодаря баркодированию разных ДНК. Это удобно в тех случаях, когда требуемый выход данных при секвенировании одного образца намного меньше максимального выхода, получаемого с одной проточной ячейки. В состав набора входит 12 бар-кодов, таким образом, в одну библиотеку можно загрузить до 12 образцов ДНК. Это позволяет снизить стоимость секвенирования одного образца почти в 10 раз.

* Полные протоколы доступны на сайте www.nanoporetech.com для зарегистрированных пользователей-участников Nanopore Community.

Пробоподготовка заключается в амплификации гена 16S со специфических праймеров (27F и 1492R), содержащих бар-коды. Затем к 5’-концам ампликонов лигируются сиквенсные адаптеры.

Анализ результатов секвенирования библиотеки, полученной с помощью 16S Barcoding Kit, проводится на платформе EPI2ME с помощью специального ПО, сортирующего риды в соответствии с баркодированием и идентифицирующего их видовую принадлежность.

В состав 16S Barcoding Kit также входит набор Flow Cell Priming Kit для загрузки библиотеки в поточную ячейку.

Условия хранения: - 20 °С.

Дополнительные расходные материалы и реактивы:

• магнитные частицы Agencourt AMPure XP (Beckman Coulter);
• 1,5 мл пробирки типа Эппендорф с низкой адгезивностью DNA LoBind (Eppendorf 0030108051);
• 0,2 мл тонкостенные пробирки для ПЦР (Thermo FS);
• вода, не содержащая нуклеаз (Thermo FS R0581);
• мастер-микс для ПЦР LongAmp Taq 2X (New England Biolabs M0287);
• свежеприготовленный 70% этанол;
• буферный раствор Tрис-HCl 10 мМ рН 8.0 с 50 мМ NaCl.

Дополнительное оборудование:

• настольная микроцентрифуга (например, Eppendorf 5452000018);
• вортекс (например, Biosan BS-010203-AAG);
• магнитный штатив (Диаэм 3336);
• ротационный перемешиватель (например, Elmi RM1L);
• амплификатор;
• набор автоматических пипеток переменного объёма - от 0,5 до 10 мкл (например, Eppendorf 3120000020), от 2 до 20 мкл (например, Eppendorf 3120000038), от 10 до 100 мкл (например, Eppendorf 3120000046), от 20 до 200 мкл (например, Eppendorf 3120000054) и от 100 до 1000 мкл (например, Eppendorf 3120000062);
• наконечники с фильтром к автоматическим пипеткам;
• термоконтейнер со льдом;
• таймер (например, TR118OS).

Опционально:

• флуориметр Qubit (Thermo FS Q33227) или аналогичный;
• система для фрагментного анализа (например,Qsep 100);
• наноспектрофотометр (например, NanoDrop 2000C).

AMGene Dye v3.1 — готовый набор реагентов, предназначенный для циклического секвенирования по методу Сенгера с использованием флуоресцентно-меченых терминирующих трифосфатов. Реакция секвенирования проводится путем циклической элонгации ДНК с нуклеотид-специфическим терминированием флуоресцентными аналогами нуклеотидов. Набор представляет собой более экономичную и качественную альтернативу реагентам BigDye Terminator v3.1, Thermo Fisher.

Основные характеристики набора AMGene Dye v3.1

• 2.5X реакционную смесь набора рекомендуется разбавлять 5Х реакционным буфером в 2–8 раз (в зависимости от параметров матрицы) для достижения максимальной эффективности реакции и в целях экономии реагентов;
• для получения более воспроизводимых результатов секвенирования рекомендуется готовить реакцию в объеме 20 мкл, однако допустимо сокращение реакционного объема до 10 мкл;
• анализ флуоресцентно меченых продуктов, полученных с использованием набора AMGene Dye v3.1, следует проводить на генетических анализаторах, которые успешно прошли спектральную калибровку для набора красителей Z (BigDye v3.1 Applied Biosystems). Для проведения первоначальной спектральной калибровки прибора (или новой капиллярной сборки в случае с ABI 3500) следует использовать или матричный стандарт (BigDye v3.1 matrix standard) или стандарт для секвенирования (BigDye v3.1 sequencing standard). Дальнейшая работа с набором не требует оптимизации протоколов, используемых для работы с реагентами BigDye Terminator v3.1, настройки генетического анализатора сохраняются, дополнительные калибровки при наличии уже существующей не требуются;
• набор совместим с различными генетическими анализаторами 3130, 3500, 3730, SeqStudio, G и A16 (ГТЗ), Нанофор-05, Honor-1616.

Состав набора и условия хранения

Хранение компонентов набора: от -18 до -25 °С в защищенном от света месте.

Транспортирование: при температуре не выше -10 °С.

Гарантийный срок годности набора: в течении 12 месяцев с даты изготовления.

Особенности набора:

* Полные протоколы доступны на сайте www.nanoporetech.com для зарегистрированных пользователей-участников Nanopore Community.

Набор предназначен для исследований, требующих простой пробоподготовки и быстрого результата, но не максимальной производительности секвенирования.

Пробоподготовка заключается в расщеплении ДНК транспозазой и присоединении к фрагментам олигонуклеотидов, содержащих сайты связывания ПЦР-праймеров. Затем каждый образец ДНК амплифицируется с помощью баркодированных праймеров. Баркодированные ампликоны объединяются, и к ним присоединяются сиквенсные адаптеры.

Длина ампликонов в среднем составляет около 2 килобаз и не зависит от длины исходной ДНК. Это связано в большей степени с особенностями пробоподготовки, а не с процессивностью Taq-полимеразы.

Поэтому для пользователей, работающих с малым исходным количеством геномной ДНК и желающих получить риды максимальной длины, рекомендуется набор Ligation Sequencing Kit и протокол Low input genomic DNA with PCR.

Набор позволяет работать с ДНК, содержащей примеси, которые снижают эффективность получения библиотеки. Это происходит благодаря стадии ПЦР. Но необходимо учитывать, что амплификация разных фрагментов может идти с разной эффективностью.

Если исходное количество ДНК менее 1 пг, рекомендуется полногеномная амплификация.

Сортировка ридов в соответствии с баркодами производится с помощью программных инструментов, доступных в рамках платформы EPI2ME.

В состав Rapid PCR Barcoding Kit также входит набор Flow Cell Priming Kit для загрузки библиотеки в поточную ячейку.

Условия хранения: -20 °С.

Дополнительные расходные материалы и реактивы:

• магнитные частицы Agencourt AMPure XP (Beckman Coulter);
• 1,5 мл пробирки типа Эппендорф с низкой адгезивностью DNA LoBind (Eppendorf 0030108051);
• 0,2 мл тонкостенные пробирки для ПЦР (Thermo FS AB0620);
• вода, не содержащая нуклеаз (Thermo FS R0581);
• мастер-микс для ПЦР LongAmp Taq 2X (New England Biolabs M0287);
• свежеприготовленный 70% этанол;
• буферный раствор Tрис-HCl 10 мМ рН 8.0 с 50 мМ NaCl.

Дополнительное оборудование:

• настольная микроцентрифуга (например, Eppendorf 5452000018);
• вортекс (например, Biosan BS-010203-AAG);
• магнитный штатив (Диаэм 3336);
• ротационный перемешиватель (например, Elmi RM1L);
• амплификатор;
• набор автоматических пипеток переменного объёма — от 0,5 до 10 мкл (например, Eppendorf 3120000020), от 2 до 20 мкл (например, Eppendorf 3120000038), от 10 до 100 мкл (например, Eppendorf 3120000046), от 20 до 200 мкл (например, Eppendorf 3120000054) и от 100 до 1000 мкл (например, Eppendorf 3120000062);
• наконечники с фильтром к автоматическим пипеткам;
• таймер (например, TR118OS).

• флуориметр Qubit (Thermo FS Q33227) или аналогичный;
• система для фрагментного анализа (например, Qsep 100);
• наноспектрофотометр (например, NanoDrop 2000C).

• объединять несколько образцов ДНК в одну библиотеку;
• свести время пробоподготовки к минимуму;
• идентифицировать модификации нуклеотидов, так как пробоподготовка проходит без ПЦР;
• использовать минимум лабораторного оборудования.

Особенности набора:

* Полные протоколы доступны на сайте www.nanoporetech.com для зарегистрированных пользователей-участников Nanopore Community.

Набор предназначен для исследований, требующих простой пробоподготовки и быстрого результата, но не максимальной производительности секвенирования. Так как количество стадий пипетирования и время подготовки минимальны, набор даёт возможность получения длинных ридов, но макcимальная длина зависит от качества исходной ДНК. Поэтому для лучшего результата рекомендуется использовать ДНК со средней длиной фрагментов не менее 30 гигабаз. Для выделения высокомолекулярной геномной ДНК можно использовать набор Blood & Cell Culture DNA Mini Kit (Qiagen).

Пробоподготовка заключается в расщеплении ДНК транспозазой и присоединении к фрагментам бар-кодов. Баркодированные фрагменты ДНК объединяются, и к ним присоединяются сиквенсные адаптеры.

Рекомендуемое исходное количество ДНК — не менее 400 нг. Возможно получение библиотеки из меньшего количества ДНК, а также из фрагментированной ДНК, но производительность будет ниже. Для получения библиотеки из меньших количеств ДНК рекомендуется набор PCR Sequencing Kit и протоколы Low Input и Rapid Low Input*.

Так как при получении библиотеки отсутствует стадия ПЦР, данный набор пригоден для выявления модифицированных нуклеотидов.

Сортировка ридов в соответствии с баркодами производится с помощью программных инструментов, доступных в рамках платформы EPI2ME.

В состав Rapid Barcoding Kit также входит набор Flow Cell Priming Kit для загрузки библиотеки в поточную ячейку.

Сиквенсные адаптеры RAP, входящие в набор, также могут быть приобретены в виде отдельного набора EXP-RAP001.

Условия хранения: -20 °С.

Дополнительные расходные материалы и реактивы:

• 1,5 мл пробирки типа Эппендорф с низкой адгезивностью DNA LoBind (Eppendorf 003010851);
• 0,2 мл тонкостенные пробирки для ПЦР (Thermo FS AB0620);
• вода, не содержащая нуклеаз (Thermo FS R0581).

Опционально:

• магнитные частицы Agencourt AMPure XP (Beckman Coulter);с
• свежеприготовленный 70% этанол;
• буферный раствор Tрис-HCl 10 мМ рН 8.0 с 50 мМ NaCl.

Дополнительное оборудование:

• настольная микроцентрифуга (например, Eppendorf 5452000018);
• вортекс (например, Biosan BS-010203-AAG);
• амплификатор;
• набор автоматических пипеток переменного объёма — от 0,5 до 10 мкл (например, Eppendorf 3120000020), от 2 до 20 мкл (например, Eppendorf 3120000038), от 10 до 100 мкл (например, Eppendorf 3120000046), от 20 до 200 мкл (например, Eppendorf 3120000054) и от 100 до 1000 мкл (например, Eppendorf 3120000062);
• наконечники с фильтром к автоматическим пипеткам;
• таймер (например, TR118OS).

Опционально:

• флуориметр Qubit (Thermo FS Q33227) или аналогичный;
• система для фрагментного анализа (например,Qsep 100);
• наноспектрофотометр (например, NanoDrop 2000C);
• магнитный штатив (Диаэм 3336);
• ротационный перемешиватель (например, Elmi RM1L).

• работать с ограниченным количеством стартового материала;
• оптимизировать ход эксперимента для получения максимальной производительности;
• исследовать дифференциальную экспрессию генов;
• характеризовать транскрипционные изоформы, варианты с альтернативным спласингом и фьюжн-транскрипты;
• секвенировать полноразмерные кДНК и анализировать их количество.

• магнитные частицы Agencourt AMPure XP (Beckman Coulter);
• мастер-микс для ПЦР LongAmp Taq 2x (New England Biolabs M0287);
• 1,5 мл пробирки типа Эппендорф с низкой адгезивностью DNA LoBind (Eppendorf 30108051);
• 0,2 мл тонкостенные пробирки для ПЦР (Axygen PCR-02-C);
• вода, не содержащая нуклеаз (Thermo Fisher Scientific R0581);
• свежеприготовленный 70% этанол;
• 10 мМ раствор dNTP (Thermo Fisher Scientific R0191);
• обратная транскриптаза Maxima H Minus (Thermo Fisher Scientific EP0751);
• ингибитор РНКаз RNAseOUT (Thermo Fisher Scientific 10777019).

• настольная микроцентрифуга (например, Eppendorf 5452000018);
• вортекс (например, Biosan BS-010203-AAG);
• магнитный штатив (Диаэм 3336);
• ротационный перемешиватель (например, Elmi RM1L);
• амплификатор (например, Thermo Fisher Scientific A37834);
• набор автоматических пипеток переменного объёма - от 0.5 до 10 мкл (например, Eppendorf 3120000020), от 2 до 20 мкл (например, Eppendorf 3120000038), от 10 до 100 мкл (например, Eppendorf 3120000046), от 20 до 200 мкл (например, Eppendorf 3120000054) и от 100 до 1000 мкл (например, Eppendorf 3120000062);
• наконечники с фильтром к автоматическим пипеткам;
• термоконтейнер со льдом;
• таймер (например, TR118OS);
• охлаждающий штатив для пробирок на 0,2 мл (например, Eppendorf 3881000031).

• флуориметр Qubit 4.0 (Thermo Q33227);
• система для фрагментного анализа (например, Qsep 100);
• наноспектрофотометр (например, NanoDrop 2000C).

• идентифицировать полноразмерные транскрипты и анализировать их количество;
• исследовать дифференциальную экспрессию генов;
• характеризовать транскрипционные изоформы, варианты с альтернативным спласингом и фьюжн-транскрипты;
• секвенировать полноразмерные кДНК без артефактов, вносимых на стадии ПЦР.

• магнитные частицы Agencourt AMPure XP (Beckman Coulter);
• набор для достройки концов ДНК NEBNext End repair / dA-tailing Module (New England Biolabs E7546);
• набор для лигирования NEB Blunt/TA Ligase Master Mix (New England Biolabs M0367);
• 1,5 мл пробирки типа Эппендорф с низкой адгезивностью DNA LoBind (Eppendorf 0030108051);
• 0,2 мл тонкостенные пробирки для ПЦР (Axygen PCR-02-C);
• вода, не содержащая нуклеаз (Thermo Fisher Scientific R0581);
• свежеприготовленный 70 % этанол;
• 10 мМ раствор dNTP (Thermo Fisher Scientific R0191);
• обратная транскриптаза Maxima H Minus (Thermo Fisher Scientific EP0751);
• ингибитор РНКаз RNAseOUT (Thermo Fisher Scientific 10777019);
• смесь РНКаз RNAse Cocktail Enzyme Mix (Thermo Fisher Scientific AM2286).

• настольная микроцентрифуга (например, Eppendorf 5452000018);
• вортекс (например, Biosan BS-010203-AAG);
• магнитный штатив (Диаэм 3336);
• ротационный перемешиватель (например, Elmi RM1L);
• амплификатор (например, Thermo Fisher Scientific A37834);
• набор автоматических пипеток переменного объёма - от 0,5 до 10 мкл (например, Eppendorf 3120000020), от 2 до 20 мкл (например, Eppendorf 3120000038), от 10 до 100 мкл (например, Eppendorf 3120000046), от 20 до 200 мкл (например, Eppendorf 3120000054) и от 100 до 1000 мкл (например, Eppendorf 3120000062);
• наконечники с фильтром к автоматическим пипеткам;
• термоконтейнер со льдом;
• таймер (например, TR118OS);
• охлаждающий штатив для пробирок на 0,2 мл (например, Eppendorf3881000031).

• флуориметр Qubit 4.0 (Thermo Q33227);
• система для фрагментного анализа (например, Qsep 100);
• наноспектрофотометр (например, NanoDrop 2000C).
  

Пятикратный (5Х) буфер для оптимизации реакции циклического секвенирования по Сенгеру, предназначен для использования с наборами для циклического секвенирования по Сенгеру AMGene Dye v3.1, BigDye Terminator v1.1 и v3.1.

Набор предназначен для исследований, требующих простой пробоподготовки и быстрого результата, но не максимальной производительности секвенирования. Так как количество стадий пипетирования и время подготовки минимальны, набор даёт возможность получения длинных ридов, но макcимальная длина зависит от качества исходной ДНК. Поэтому для лучшего результата рекомендуется использовать ДНК со средней длиной фрагментов не менее 30 гигабаз. Для выделения высокомолекулярной геномной ДНК можно использовать набор Blood & Cell Culture DNA Mini Kit (Qiagen).

Рекомендуемое исходное количество ДНК — не менее 400 нг. Возможно получение библиотеки из меньшего количества ДНК, а также из фрагментированной ДНК, но производительность будет ниже. Для получения библиотеки из меньших количеств ДНК рекомендуется набор PCR Sequencing Kit и протоколы Low Input и Rapid Low Input.

Так как при получении библиотеки отсутствует стадия ПЦР, данный набор пригоден для выявления модифицированных нуклеотидов.

Дополнительные расходные материалы:

• 1,5 мл пробирки типа Эппендорф с низкой адгезивностью DNA LoBind (30108051);
• 0,2 мл тонкостенные пробирки для ПЦР PCR-02-C);
• вода, не содержащая нуклеаз (R0581).

Дополнительное оборудование:

• настольная микроцентрифуга (например, Eppendorf 5452000018);
• вортекс (например, Biosan BS-010203-AAG);
• амплификатор (например, Thermo Fisher Scientific A37834);
• набор автоматических пипеток переменного объёма — от 0,5 до 10 мкл (например, Eppendorf 3120000020), от 2 до 20 мкл, от 10 до 100 мкл (например, Eppendorf 3120000046), от 20 до 200 мкл (например, Eppendorf 3120000054) и от 100 до 1000 мкл (например, Eppendorf 3120000062);
• наконечники с фильтром к автоматическим пипеткам;
• таймер (например, TR118OS).

Опционально:

• флуориметр Qubit 4.0 или аналогичный.

Особенности набора:

Набор оптимизирован для хранения при температуре окружающей среды, так как реагенты в его составе находятся в лиофилизированном виде.

Количество стадий пипетирования и время подготовки минимальны, поэтому набор даёт возможность получения длинных ридов, но максимальная длина зависит от качества исходной ДНК.

Рекомендуемое исходное количество ДНК — не менее 400 нг. Возможно получение библиотеки из меньшего количества ДНК, а также из фрагментированной ДНК, но производительность будет ниже.

Так как при получении библиотеки отсутствует стадия ПЦР, данный набор пригоден для выявления модифицированных нуклеотидов.

В состав Field Sequencing Kit также входит набор Flow Cell Priming Kit для загрузки библиотеки в поточную ячейку.

• 1,5 мл пробирки типа Эппендорф с низкой адгезивностью DNA LoBind (30108051);
• 0,2 мл тонкостенные пробирки для ПЦР PCR-02-C);
• вода, не содержащая нуклеаз (R0581).

• термостат или любое устройство с нагревом до +80 °С;
• набор автоматических пипеток переменного объёма — от 0.5 до 10 мкл (например, Eppendorf 3120000020), от 2 до 20 мкл (например, Eppendorf 3120000038), от 10 до 100 мкл (например, Eppendorf 3120000046), от 20 до 200 мкл (например, Eppendorf 3120000054) и от 100 до 1000 мкл (например, Eppendorf 3120000062);
• наконечники с фильтром к автоматическим пипеткам.

Настольный высокопроизводительный NGS-секвенатор для различных применений. Имеет возможность проведения генерации кластеров ДНК и секвенирования в одном приборе, без выполнения ручных операций. Для удобства управления системой имеется встроенный сенсорный экран. Секвенатор также имеет полный набор программного обеспечения (с возможностью обновления) для управления системой и первичной обработки данных и встроенный аппаратный модуль для ускорения вычислений

Основные применения высокопроизводительного NGS-секвенатора GenoLab M

• секвенирование экзома;
• секвенирование полных геномов;
• таргетное секвенирование (ампликоны, панели генов);
• секвенирование транскриптомов;
• метагеномное секвенирование;
• анализ степени метилирования ДНК;
• анализ ДНК-белковых взаимодействий;
• секвенирование свободно-циркулирующей ДНК;
• НИПТ, ПГТ-А.

Характеристики NGS-секвенатора GenoLab M

• количество рабочих ячеек секвенатора, шт. – 2;
• возможность запуска двух ячеек независимо (запуск второй ячейки во время текущего запуска первой ячейки);
• возможность управления прибором с помощью сенсорного экрана;
• количество типов нуклеотидов, одновременно подаваемых в реакционный модуль в каждом цикле секвенирования – 4;
• максимальное количество прочтений на одну ячейку, млн – 500;
• максимальная производительность за один полный запуск прибора, Гб – 300;
• поддержка одноконцевых и парноконцевых прочтений;
• максимальная длина считываемого фрагмента ДНК при чтении с одного конца, нуклеотидов – 150;
• максимальная длина считываемого фрагмента ДНК при парноконцевом чтении, нуклеотидов – 300;
• максимальное время, необходимое для полного цикла работы прибора (включая генерацию кластеров, секвенирование ДНК и первичный анализ данных), ч – 72;
• поддержка библиотек TruSeq и Nextera;
• средняя точность прочтения по результатам всего запуска (Q30) – 80% оснований с точностью прочтения 99,9%;
• требования к сети – 220 В; 50/60 Гц;
• габаритные размеры (Ш×Г×В), мм – 1200×685×595;
• вес, кг – 280.

Комплектация секвенатора GenoLab M

• секвенатор;
• стартовый набор для инсталляции и обучения;
• набор для секвенирования (на выбор в зависимости от задач пользователя);
• источник бесперебойного питания;
• управляющий ПК (операционная система — Windows 10 Pro, CPU: Xeon SR 4216, Память: 192 DDR4; Hard Disk 1: 1 TB SSD; Hard Disk 2: 10 TB HDD);
• монтаж, пуско-наладка, инструктаж персонала на рабочем месте;
• гарантийное обслуживание 12 месяцев (возможна покупка дополнительной гарантии).

Прибор зарегистрирован в РФ в качестве медицинского изделия. РЗН 2025/24616.

В комплект поставки входит:

• проточная ячейка FCM на 250М прочтений, шт. — 2;
• проточная ячейка FCH на 500М прочтений, шт. — 2;
• картридж для парноконцевого прочтения 75 циклов, шт. — 1;
• картридж для парноконцевого прочтения 150 циклов, шт. — 1;
• картридж для парноконцевого прочтения 300 циклов, шт. — 2.

Настольный высокопроизводительный NGS-секвенатор для диагностических целей. Имеет возможность проведения генерации кластеров ДНК и секвенирования в одном приборе, без выполнения ручных операций. Для удобства управления системой имеется встроенный сенсорный экран. Секвенатор также имеет полный набор программного обеспечения (с возможностью обновления) для управления системой и первичной обработки данных и встроенный аппаратный модуль для ускорения вычислений.

Основные области применения NGS-секвенатора Геноскан 4000

• Секвенирование экзома;
• секвенирование полных геномов;
• таргетное секвенирование (ампликоны, панели генов);
• секвенирование транскриптомов;
• метагеномное секвенирование;
• анализ степени метилирования ДНК;
• анализ ДНК-белковых взаимодействий;
• секвенирование свободно-циркулирующей ДНК;
• НИПТ, ПГТ-А.

Характеристики NGS-секвенатора Геноскан 4000

• Количество рабочих ячеек секвенатора, шт. — 2;
• возможность запуска двух ячеек независимо (запуск второй ячейки во время текущего запуска первой ячейки);
• возможность управления прибором с помощью сенсорного экрана;
• количество типов нуклеотидов, одновременно подаваемых в реакционный модуль в каждом цикле секвенирования — 4;
• максимальное количество прочтений на одну ячейку, млн — 500;
• максимальная производительность за один полный запуск прибора, Гб — 300;
• поддержка одноконцевых и парноконцевых прочтений;
• максимальная длина считываемого фрагмента ДНК при чтении с одного конца, нуклеотидов — 150;
• максимальная длина считываемого фрагмента ДНК при парноконцевом чтении, нуклеотидов — 300;
• максимальное время, необходимое для полного цикла работы прибора (включая генерацию кластеров, секвенирование ДНК и первичный анализ данных), ч — 72;
• поддержка библиотек TruSeq и Nextera;
• средняя точность прочтения по результатам всего запуска (Q30) — 80% оснований с точностью прочтения 99,9%;
• требования к сети — 220 В; 50/60 Гц;
• габаритные размеры, Ш×Г×В, мм — 1200×685×595;
• вес, кг — 280.

Комплектация секвенатора Геноскан 4000

• Секвенатор;
• стартовый набор с 4-мя ячейками;
• сканнер штрих-кодов;
• источник бесперебойного питания;
• управляющий ПК (операционная система — Windows 10 Pro, CPU: Xeon SR 4216, Память: 192 DDR4; Hard Disk 1: 1 TB SSD; Hard Disk 2: 10 TB HDD);
• монтаж, пуско-наладка, инструктаж персонала на рабочем месте;
• гарантийное обслуживание 12 месяцев (возможна покупка дополнительной гарантии).

PolyseqOne — это портативная система нанопорового секвенирования средней производительности, позволяющая проводить анализ в режиме реального времени. Компания Polyseq Biotechnology разработала собственные нанопоровые белки, наборы для подготовки библиотек и секвенирования, конструкцию чипа, программную инженерию и алгоритмы глубокого обучения.

Нанопоровые белки закреплены на полимерной мембране, которая окружена электролитным раствором с обеих сторон. Ионы электролита проходят через нанопору, создавая постоянный электрический ток. Молекулы ДНК или РНК обладают электрическим зарядом, и под действием электрического поля одноцепочечные молекулы проходят через нанопору от отрицательно заряженной стороны (cis) к положительно заряженной (trans). Поскольку размер и заряд нуклеотидов различаются, ток через пору изменяется (возникают флуктуации). Эти колебания регистрируются и с помощью распознавания паттернов преобразуются в последовательность ДНК.

Основные применения нанопорового секвенатора Polyseq One

• Полногеномное секвенирование (WGS). Например, прочтение от теломеры к теломере (T2T), включая сложные регионы (повторы, центромеры).
• Структурные вариации. Детекция крупных делеций, инверсий, дупликаций.
• Прямое секвенирование РНК.
• Выявление редких транскриптов и клеточных субпопуляций.
• Сборка полных геномов бактерий из сложных образцов.
• Разделение метагеномных данных на отдельные геномы.
• Детекция эпигенетических изменений.
• Экологический мониторинг.
• Сборка сложных полиплоидных геномов.

Характеристики нанопорового секвенатора Polyseq One

• Точность одного прочтения, % — 97;
• длина прочтений, Kb — ≥300;
• консенсусная точность (50×), % — 99,99;
• количество пор на чипе — 2560;
• возможность использовать чип повторно — до 5 раз;
• скорость прочтения, нуклеотидов/с — 400;
• максимальный расчетный объем получаемых данных, Гб — 60;
• реальный объем получаемых данных, Гб — 30;
• адаптивное секвенирование;
• время работы, ч — до 96;
• наборы для подготовки библиотек, секвенирования, баркодирования;
• габаритные размеры (Ш×Г×В), мм — 180×130×80;
• вес инструмента, кг — 1,5.

Комплектация нанопорового секвенатора Polyseq One

• Cеквенатор;
• программное обеспечение на носителе;
• проточная ячейка;
• набор для построения библиотек;
• монтаж, пуско-наладка, инструктаж персонала на рабочем месте;
• гарантийное обслуживание 12 месяцев (возможна покупка дополнительной гарантии).

Набор содержит один планшет, заполненный 32 одноразовыми бар-кодами, и закрытый прокалываемой фольгой, что исключает риск перекрестного загрязнения между лунками. Бар-коды можно гибко использовать с шагом от 1 до 32, пока не закончатся все бар-коды. При использовании вместе с полосками для библиотек Ion Torrent Genexus 1 и 2AS этот набор обеспечивает гибкую, полностью автоматизированную подготовку и стандартизацию до 32 библиотек Ion AmpliSeq.

Применение

• Секвенирование, таргетное секвенирование библиотек;
• автоматизирует подготовку библиотек для библиотек Ion AmpliSeq с 200-400 базовыми считываниями;
• экономически эффективная поддержка вариабельности образцов для клинических исследований;
• максимальная гибкость благодаря возможности подготовки от 1 до 32 библиотек с одним пулом за прогон;
• обеспечивает параллельную обработку до четырех совместимых анализов за один цикл;
• быстрая и простая настройка прибора, занимающая менее пяти минут.

Характеристики

• Количество реакций, 32;
• тип образца — ДНК, РНК;
• тип секвенирования — секвенирование генома, ДНК и РНК;
• совместимость с оборудованием — интегрированный секвенатор Genexus.

Транспортировка и хранение — при комнатной температуре.

Генетический анализатор 3500 — это 8-капиллярный прибор, который может использоваться для широкого спектра задач, включая секвенирование de novo и ресеквенирование (мутационное профилирование), а также микросателлитный анализ, MLPA, LOH, MLST и валидацию или скрининг SNP. Большинство из этих приложений может быть выполнено на одном типе полимера и капиллярной сборке одной длины.

Генетические анализаторы серии 3500 были разработаны более 15 лет назад и по настоящее время являются непревзойденными по качеству получаемых данных и удобству использования приборами и являют собой эталон в данной области приборостроения.

Серия 3500 использует готовые расходные материалы с предварительно упакованными полимерными пакетами, катодными и анодными буферными контейнерами и легко устанавливаемыми капиллярными сборками. Каждый из этих расходных материалов оснащен RFID-метками, которые позволяют просматривать, отслеживать и сообщать важную информацию о реагентах и расходных материалах, включая данные об использовании, номере партии, номере детали, сроке годности и сроке службы на приборе, в программном обеспечении для сбора данных Data Collection.

Программное обеспечение для сбора данных Data Collection отличается удобной навигацией: интуитивно понятный дизайн приборной панели, хорошо заметные кнопки для выполнения общих операций, легко читаемые графические дисплеи для контроля состояния расходных материалов, а также удобный календарь планирования технического обслуживания. Функциональные возможности этого ПО включают упрощенную настройку планшетов и встроенный первичный анализ с контролем качества, что позволяет принимать решения о качестве данных по мере их получения на приборе без необходимости передачи выходных файлов в программные пакеты вторичного анализа.

Характеристики генетического анализатора 3500

• Количество капилляров в блоке — 8;
• лазерный источник света;
• длина волны, нм — 505;
• количество детектируемых мишеней — 6;
• формат планшет — 96 или 384 лунки;
• производительность за запуск, п.н. — 3,2-8,0×10³;
• система контроля и оптимизации расхода полимера;
• кассеты с РОР полимером 3х типов (POP-4, POP-6, POP-7):
  • на 96 образцов (12 инъекций);
  • на 384 образца (60 инъекций);
  • на 960 образов (120 инъекций);
• обязательное подключение к ПК;
• расходные материалы — контейнеры с анодным и катодным буферами, пакет с реагентом для промывки капилляров, сменный блок с капиллярами, пакет с POP-полимером;
• индикатор расхода реагентов с функцией календаря и уведомлением о необходимости замены;
• мощность (без компьютера), Вт — 271;
• габариты, Ш×Г×В, мм — 610×610×720;
• вес, кг — 82.

Комплект поставки: генетический анализатор 3500 (с основным ПО для секвенирования и фрагментного анализа), обучение запуску, управляющий компьютер с установленной программой Data Collection (управление и сбор данных, первичный анализ), кассета для загрузки планшет, инсталляционный комплект для секвенирования и фрагментного анализа.

Генетический анализатор 3500xL — это 24-капиллярный прибор, который может использоваться для широкого спектра задач, включая секвенирование de novo и ресеквенирование (мутационное профилирование), а также микросателлитный анализ, MLPA, LOH, MLST и валидацию или скрининг SNP. Большинство из этих приложений может быть выполнено на одном типе полимера и капиллярной сборке одной длины.

Генетические анализаторы серии 3500 были разработаны более 15 лет назад и по настоящее время являются непревзойденными по качеству получаемых данных и удобству использования приборами и являют собой эталон в данной области приборостроения.

Серия 3500 использует готовые расходные материалы с предварительно упакованными полимерными пакетами, катодными и анодными буферными контейнерами и легко устанавливаемыми капиллярными сборками. Каждый из этих расходных материалов оснащен RFID-метками, которые позволяют просматривать, отслеживать и сообщать важную информацию о реагентах и расходных материалах, включая данные об использовании, номере партии, номере детали, сроке годности и сроке службы на приборе, в программном обеспечении для сбора данных Data Collection.

Программное обеспечение для сбора данных Data Collection отличается удобной навигацией: интуитивно понятный дизайн приборной панели, хорошо заметные кнопки для выполнения общих операций, легко читаемые графические дисплеи для контроля состояния расходных материалов, а также удобный календарь планирования технического обслуживания. Функциональные возможности этого ПО включают упрощенную настройку планшетов и встроенный первичный анализ с контролем качества, что позволяет принимать решения о качестве данных по мере их получения на приборе без необходимости передачи выходных файлов в программные пакеты вторичного анализа.

Характеристики генетического анализатора 3500xL

• Количество капилляров в блоке — 24;
• лазерный источник света;
• длина волны, нм — 505;
• количество детектируемых мишеней — 6;
• формат планшет — 96 или 384 лунки;
• производительность за запуск, п.н. — 9,6-24,0×10³;
• система контроля и оптимизации расхода полимера;
• пакеты с РОР-полимером 3х типов (POP-4, POP-6, POP-7):
  • на 96 образцов (5 инъекций);
  • на 384 образца (20 инъекций);
  • на 960 образов (50 инъекций);
• обязательное подключение к ПК;
• расходные материалы — контейнеры с анодным и катодным буферами, пакет с реагентом для промывки капилляров, сменный блок с капиллярами, пакет с POP-полимером;
• индикатор расхода реагентов с функцией календаря и уведомлением о необходимости замены;
• мощность (без компьютера), Вт — 271;
• габариты, Ш×Г×В, мм — 610×610×720;
• вес, кг — 82.

Комплект поставки: генетический анализатор 3500 (с основным ПО для секвенирования и фрагментного анализа), обучение запуску, управляющий компьютер с установленной программой Data Collection (управление и сбор данных, первичный анализ), кассета для загрузки планшет, инсталляционный комплект для секвенирования и фрагментного анализа.

Наборы Holotype HLA — это современное решение для диагностики и определения человеческих лейкоцитарных антигенов (HLA). Они работают на основе метода секвенирования следующего поколения (NGS) на платформах Illumina и GeneMind. Эти наборы реагентов сочетают в себе высокую точность и удобство использования, позволяют получить информацию о гистосовместимости 5, 7, 11 локусов HLA в зависимости от типа набора. Материал для исследования — образцы геномной ДНК человека.

Подготовка образцов

• Анализ по 5 (А, В, С, DRB1, DQB1), 7 (А, В, С, DRB1, DQB1, DPB1, DQA1) или 11 (А, В, С, DRB1, DQB1, DPB1, DQA1, DRB3, DRB4, DRB5, DPA1) локусам HLA;
• для амплификации 11 локусов требуется менее 0,8 мкг ДНК;
• исходный материал — периферическая кровь, слюна, буккальный эпителий;
• одновременная загрузка до 288 образцов на стандартной проточной ячейке в 300 циклов с плотностью кластеров до 1000 K/mm².

Подготовка библиотеки

• Подготовка библиотеки для 24 образцов занимает 4 часа практического времени;
• получение результатов менее чем за 48 часов;
• библиотеки Holotype можно комбинировать с другими библиотеками, это позволит оптимизировать затраты на процесс секвенирования.

Секвенирование

• Секвенирование проводят на платформах Illumina: MiniSeq, MiSeq, iSeq и NextSeq, и на платформе GeneMind: FASTASeq 300;
• наборы совместимы с проточными ячейками любого размера в зависимости от необходимой пропускной способности;
• поддерживается химия на 300 и 500 циклов.

Анализ данных с помощью программного обеспечения HLA TWIN

• Полностью автоматизированный анализ после запуска секвенирования на платформе Illumina и GeneMind;
• время анализа образца из 11 локусов менее 5 минут с рекомендуемыми характеристиками;
• два независимых алгоритма генотипирования;
• 24 показателя контроля качества для получения достоверных результатов;
• сбалансированное покрытие между аллелями в локусе, между локусами в образце и среди образцов;
• глубокое и равномерное покрытие по всей длине целевого региона.

Технические характеристики Набора Holotype HLA 96/7

• Набор Holotype HLA 96/7 содержит все необходимые праймеры и реагенты, а также 96-луночный планшет для подготовки библиотеки;
• один набор рассчитан на анализ 96 образцов;
• типирование по 7 локусам HLA — I класса (A, B и C) и II класса (DPB1, DQA1, DQB1 и DRB1);
• набор Holotype HLA 96/7 может быть выполнен в одной из 3-х конфигураций, A, B, C, отличающихся идентификационными номерами лунок в планшете для подготовки библиотек. В конфигурации A стандартная идентификация от 1 до 96, в В — от 97 до 192, в С — от 193 до 288. Совместное использование 3-х конфигураций набора позволяет одновременно проанализировать до 288 образцов;
• ПО в комплекте;
• наличие регистрационного удостоверения МИ (РЗН 2024/23361).

Наборы Holotype HLA — это современное решение для диагностики и определения человеческих лейкоцитарных антигенов (HLA). Они работают на основе метода секвенирования следующего поколения (NGS) на платформах Illumina и GeneMind. Эти наборы реагентов сочетают в себе высокую точность и удобство использования, позволяют получить информацию о гистосовместимости 5, 7, 11 локусов HLA в зависимости от типа набора. Материал для исследования — образцы геномной ДНК человека.

Подготовка образцов

• Анализ по 5 (А, В, С, DRB1, DQB1), 7 (А, В, С, DRB1, DQB1, DPB1, DQA1) или 11 (А, В, С, DRB1, DQB1, DPB1, DQA1, DRB3, DRB4, DRB5, DPA1) локусам HLA;
• для амплификации 11 локусов требуется менее 0,8 мкг ДНК;
• исходный материал — периферическая кровь, слюна, буккальный эпителий;
• одновременная загрузка до 288 образцов на стандартной проточной ячейке в 300 циклов с плотностью кластеров до 1000 K/mm².

Подготовка библиотеки

• Подготовка библиотеки для 24 образцов занимает 4 часа практического времени;
• получение результатов менее чем за 48 часов;
• библиотеки Holotype можно комбинировать с другими библиотеками, это позволит оптимизировать затраты на процесс секвенирования.

Секвенирование

• Секвенирование проводят на платформах Illumina: MiniSeq, MiSeq, iSeq и NextSeq, и на платформе GeneMind: FASTASeq 300;
• наборы совместимы с проточными ячейками любого размера в зависимости от необходимой пропускной способности;
• поддерживается химия на 300 и 500 циклов.

Анализ данных с помощью программного обеспечения HLA TWIN

• Полностью автоматизированный анализ после запуска секвенирования на платформе Illumina и GeneMind;
• время анализа образца из 11 локусов менее 5 минут с рекомендуемыми характеристиками;
• два независимых алгоритма генотипирования;
• 24 показателя контроля качества для получения достоверных результатов;
• сбалансированное покрытие между аллелями в локусе, между локусами в образце и среди образцов;
• глубокое и равномерное покрытие по всей длине целевого региона.

Технические характеристики Набора Holotype HLA 96/5

• Набор Holotype HLA 96/5 содержит все необходимые праймеры и реагенты, а также 96-луночный планшет для подготовки библиотеки;
• один набор рассчитан на анализ 96 образцов;
• типирование по 5 локусам HLA — I класса (A, B и C) и II класса (DRB1, DQB1);
• набор Holotype HLA 96/5 может быть выполнен в одной из 3-х конфигураций, A, B, C, отличающихся идентификационными номерами лунок в планшете для подготовки библиотек. В конфигурации A стандартная идентификация от 1 до 96, в В — от 97 до 192, в С — от 193 до 288. Совместное использование 3-х конфигураций набора позволяет одновременно проанализировать до 288 образцов;
• ПО в комплекте;
• наличие регистрационного удостоверения МИ (РЗН 2024/23361).

Наборы Holotype HLA — это современное решение для диагностики и определения человеческих лейкоцитарных антигенов (HLA). Они работают на основе метода секвенирования следующего поколения (NGS) на платформах Illumina и GeneMind. Эти наборы реагентов сочетают в себе высокую точность и удобство использования, позволяют получить информацию о гистосовместимости 5, 7, 11 локусов HLA в зависимости от типа набора. Материал для исследования — образцы геномной ДНК человека.

Подготовка образцов

• Анализ по 5 (А, В, С, DRB1, DQB1), 7 (А, В, С, DRB1, DQB1, DPB1, DQA1) или 11 (А, В, С, DRB1, DQB1, DPB1, DQA1, DRB3, DRB4, DRB5, DPA1) локусам HLA;
• для амплификации 11 локусов требуется менее 0,8 мкг ДНК;
• исходный материал — периферическая кровь, слюна, буккальный эпителий;
• одновременная загрузка до 288 образцов на стандартной проточной ячейке в 300 циклов с плотностью кластеров до 1000 K/mm².

Подготовка библиотеки

• Подготовка библиотеки для 24 образцов занимает 4 часа практического времени;
• получение результатов менее чем за 48 часов;
• библиотеки Holotype можно комбинировать с другими библиотеками, это позволит оптимизировать затраты на процесс секвенирования.

Секвенирование

• Секвенирование проводят на платформах Illumina: MiniSeq, MiSeq, iSeq и NextSeq, и на платформе GeneMind: FASTASeq 300;
• наборы совместимы с проточными ячейками любого размера в зависимости от необходимой пропускной способности;
• поддерживается химия на 300 и 500 циклов.

Анализ данных с помощью программного обеспечения HLA TWIN

• Полностью автоматизированный анализ после запуска секвенирования на платформе Illumina и GeneMind;
• время анализа образца из 11 локусов менее 5 минут с рекомендуемыми характеристиками;
• два независимых алгоритма генотипирования;
• 24 показателя контроля качества для получения достоверных результатов;
• сбалансированное покрытие между аллелями в локусе, между локусами в образце и среди образцов;
• глубокое и равномерное покрытие по всей длине целевого региона.

Технические характеристики Набора Holotype HLA 24/7

• Набор Holotype HLA 24/7 содержит все необходимые праймеры и реагенты, а также 24-луночный планшет для подготовки библиотеки;
• один набор рассчитан на анализ 24 образцов;
• типирование по 7 локусам HLA — I класса (A, B и C) и II класса (DPB1, DQA1, DQB1 и DRB1);
• набор Holotype HLA 24/7 может быть выполнен в одной из 4-х конфигураций, A1, A2, A3, A4, отличающихся идентификационными номерами лунок в планшете для подготовки библиотек. В конфигурации A1 стандартная идентификация от 1 до 24, в А2 – от 25 до 48, в А3 — от 49 до 72, в А4 — от 73 до 96. Совместное использование 4-х конфигураций набора позволяет одновременно проанализировать до 96 образцов;
• ПО в комплекте;
• наличие регистрационного удостоверения МИ (РЗН 2024/23361).

Набор обеспечивает более удобный, быстрый и высокопроизводительный процесс очистки по сравнению с аналогами других компаний. После ПЦР-амплификации очистка ПЦР-ампликонов требуется для многих последующих применений (включая гидролиз эндонуклеазами рестрикции, лигирование, секвенирование и мечение ДНК) для того, чтобы предотвратить перенос ферментов (полимеразы, эндонуклеазы рестрикции) и компонентов реакции (dNTPs, праймеры, буферы, соли), которые могут негативно влиять на последующие манипуляции с ДНК. Набор применим только для выделения и очистки линейных (не кольцевых) фрагментов ДНК.

Преимущества набора PureLink PCR Purification Kit:

• быстрая процедура выделения (10 минут);
• высокий выход целевого продукта — до 40 мкг ДНК;
• нет необходимости контролировать рН образца;
• позволяет опционно выделять фрагменты ДНК размером 300-600 п.н., или удалять фрагменты менее 300 п.н.

Выделенная ДНК может использоваться для следующих приложений:

• ПЦР;
• секвенирование ДНК;
• молекулярное клонирование;
• гидролиз эндонуклеазами рестрикции.

Условия хранения и перевозки: при комнатной температуре.

Набор идеально подходит для очистки и концентрации ДНК, полученных в ходе низкоэффективных реакций ПЦР или реакций гидролиза рестриктазами. Очищенные фрагменты ДНК и ампликоны пригодны для использования в последующих приложениях, таких как секвенирование ДНК, гидролиз рестриктазами, клонирование, ПЦР.

Преимущества набора PureLink PCR Micro Kit:

• быстрая процедура выделения (10 минут);
• эффективно работает с фрагментами ДНК от 100 п.н. до 12 000 п.н.;
• эффективность очистки от праймеров, нуклеотидов, ферментов и солей превышает 98,5%;
• уникальная конструкция колонки позволяет выделять до 95% фрагментов ДНК из элювиата объемом всего 5 мкл.

Выделенная ДНК может использоваться для следующих приложений:

• ПЦР;
• секвенирование ДНК;
• нозерн-блоттинг;
• молекулярное клонирование;
• гидролиз эндонуклеазами рестрикции.

Условия хранения и перевозки: при комнатной температуре.

Набор предназначен для выделения плазмидной ДНК из 1-5 мл ночной бактериальной культуры. В наборе используется технология спин-колонок и оптимизированные буферные растворы ERB и ERW, что позволяет специфически связывать плазмиду и эффективно удалять эндотоксины, белки и другие примеси. Процесс выделения занимает всего 25 мин. Выделенная ДНК содержит остаток эндотоксина в концентрации менее 0,1 EU/мкг и может быть использована для трансфекций различных клеток и других экспериментов, включая гидролиз эндонуклеазами рестрикции, ПЦР, секвенирование и т.д.

Преимущества набора FastPure EndoFree Plasmid Mini

• Быстрая процедура выделения — 25 минут;
• выделение плазмидной ДНК из 1-5 мл ночной бактериальной культуры;
• выход плазмидной ДНК до 50 мкг;
• концентрация эндотоксина в выделенной ДНК, EU/мкг — менее 0,1;
• не требуется экстракция фенолом/хлороформом или осаждение спиртом;
• полученная ДНК идеально подходит для чувствительных приложений, например таких как трансфекция.

Выделенная ДНК может использоваться для следующих приложений

• Гидролиз эндонуклеазами рестрикции;
• трансфекция;
• ПЦР;
• секвенирование ДНК;
• in vitro транскрипция;
• трансформация.

Условия хранения: комнатная температура.

В наборе используются колонки с усовершенствованными кремнеземными мембранами, которые позволяют выделить плазмидную ДНК пригодную для трансфекции (<1 EU/мкг) за 30 минут. Простой протокол дает возможность получить до 0,4 мг плазмиды, пригодной для стандартной трансфекции и всех методов молекулярной биологии, таких как клонирование и секвенирование.

Преимущества набора PureLink Fast Low-Endotoxin Midi Plasmid Purification Kit:

Выделенная ДНК может использоваться для следующих приложений:

В наборе для выделения плазмидной ДНК PureLink Fast Low-Endotoxin Maxi Plasmid Purification Kit используются колонки следующего поколения с усовершенствованными кремнеземными мембранами, которые позволяют выделить плазмидную ДНК, пригодную для трансфекции (<1 EU/мкг) примерно за 30 минут. Простой протокол без осаждения дает до 1,5 мг плазмидной ДНК, подходящую для стандартных трансфекций и всех применений в молекулярной биологии, таких как клонирование и секвенирование.

Преимущества набора PureLink Expi Endotoxin-Free Mega Plasmid Purification Kit:

• очень быстрая процедура выделения (30 минут);
• выделение плазмидной ДНК из 150 мл ночной бактериальной культуры с выходом до 1,5 мкг ДНК;
• выделенные плазмиды не содержат эндотоксинов (концентрация эндотоксинов <0,1 EU/мкг) и идеально подходят для чувствительных приложений;
• набор оснащен окрашенными буферами, которые позволяют безошибочно визуализировать полный лизис бактериальных клеток и последующую нейтрализацию.

Выделенная ДНК может использоваться для следующих приложений:

• трансфекция;
• ПЦР;
• секвенирование ДНК.
• in vitro трансрипция;
• гидролиз эндонуклеазами рестрикции.

Условия хранения и перевозки: при комнатной температуре.

Характеристки секвенатора нанопорового GridION Mk1

GridION X5 – Capex, в отличие от MinION, состоит из пяти проточных ячеек с нанопоровыми каналами и обладает теми же достоинствами, что и MinION – простая пробоподготовка и быстрое секвенирование молекул нуклеиновых кислот любой длины.

Пять ячеек позволяют проводить пять параллельных независимых экспериментов, что удобно для лабораторий с большим объёмом исследований. Общий объём информации о последовательности ДНК, полученный с помощью GridION Х5, может быть до 150 Гб (объём встроенного SSD-диска – 4 Тб).

В отличие от MinION, в корпус GridION уже встроены все компоненты, необходимые для управления секвенированием и обработки данных:

• объем SSD-диска, Тб – 4;
• объем оперативной памяти, Гб – 64;
• центральный процессор последнего поколения;
• ускорители на основе графического процессора (видеокарта Nvidia GV100, 100 Тфлопс);
• ОС Linux;
• программное обеспечение для секвенирования и обработки данных.

Комплект поставки: секвенатор GridION X5 – Capex со встроенным ПК.

Идентификация видов, присутствующих в образцах пищевых продуктов и кормах, является важным критерием для подтверждения подлинности, проверки происхождения, отслеживаемости сырья и для контроля качества процессов обработки на линиях производства.

Рабочий процесс Thermo Scientific NGS Food использует технологию секвенирования следующего поколения Ion Torrent для обеспечения нецелевого подхода к скринингу, позволяющего идентифицировать виды, содержащиеся в пищевых образцах как однокомпонентного, так и многокомпонентного сырья, путем сравнения с базой данных ДНК видов мяса, растений или рыб.

Ключевая особенность секвенатора ДНК 2-го поколения Ion GeneStudio S5:

• сокращение времени работы и сложности – реактивы plug-and-play на основе картриджа;
• быстрое получение результатов анализа – полный цикл секвенирования и анализ за часы;
• гибкая пропускная способность – выбрать чип, соответствующий вашим требованиям к пропускной способности (набор микросхем Ion 510 или 520 для идентификации видов пищевых продуктов).

Система Ion GeneStudio S5 использует скорость полупроводникового секвенирования, которая обеспечивает получение высококачественных данных секвенирования за несколько часов и позволяет перейти от библиотеки ДНК к данным всего за 24 часа. Благодаря однодневной установке, простому пользовательскому интерфейсу и картриджам с реагентами система Ion GeneStudio S5 проста и удобна в использовании.

Преимущества автоматизированного NGS-скрининга для мультивидовой идентификации:

• детекция всех мишеней (мясо, рыба и растения) в одном запуске;
• надежные результаты образцов из нескольких категорий продуктов питания (готовые к употреблению блюда, свежие продукты, супы, консервы и т. д);
• реагенты на основе картриджей «включай и работай»;
• быстрые результаты – полный цикл секвенирования и анализ за 24 часа;
• секвенирование ДНК – наиболее достоверный метод для подтверждения вида;
• методика определения вида методом секвенирования соответствует международному стандарту ISO TC 34/SC 16 ISO 22949-1 и ГОСТ 34106-2017.

Товар временно недоступен. Аналоги по запросу ниже.

• Количество капилляров в блоке — 4;
• длина капилляров, см — 28;
• формат — 96-луночные планшеты или 8-луночные стрипы;
• количество детектируемых мишеней — 6;
• два типа картриджей: 125 инъекций (500 образцов) и 250 инъекций (1000 образцов);
• универсальный полимер (POP-1) для секвенирования и фрагментного анализа;
• не требует спектральной калибровки при использовании наборов Applied Biosystems;
• встроенное ПО для управления SeqStudio Data Collection;
• подключение к ПК – не обязательно;
• мощность (без компьютера), Вт — 271;
• габариты, Ш × Г ×В, мм — 495 × 648 × 442;
• вес, кг — 45,4.

• Sequencing Analysis Software — анализ, редактирование и интерпретация первичных результатов секвенирования.
• SeqScape Software — детекция и анализ мутаций, изучение и валидирование SNP, типирование патогенов, идентификация аллелей и подтверждение последовательностей на основании данных из библиотеки, ресеквенирование.
• Variant Reporter — выявление и анализ мутаций, обнаружение и оценка SNP и подтверждение последовательности.
• GeneMapper Software — для всех основных приложений фрагментного анализа (генотипирование, дискриминация аллелей, анализ однонуклеотидных полиморфизмов).
• Minor Variant Finder (обнаружение минорных мутаций (SNP).
• MicroSEQ ID — секвенирование и идентификация микроорганизмов (приобретается отдельно).

Комплект поставки: генетический анализатор SeqStudio (с основным ПО), расширенная гарантия (2 года), обучение запуску, ноутбук с установленной программой управления и сбора данных и анализа, стартовый набор для запуска прибора (4-х капиллярный картридж, протектор, катодный буфер, необходимые расходные материалы).

Дополнительно: однодневное обучение генетическому анализу.